Ksiądz, profesor Uniwersytetu Jana Pawła II oraz autor wielu publikacji z dziedziny teologii duchowości, wybitny znawca teologii Bożego Miłosierdzia.

Ks. Jan Machniak oprócz seminarium ukończył również studia polonistyczne na Uniwersytecie Jagiellońskim. Święcenia kapłańskie otrzymał 19 maja 1985 w Katedrze na Wawelu z rąk kard. Franciszka Macharskiego. Doktorat uzyskał na Papieskim Uniwersytecie Świętego Tomasza z Akwinu w Rzymie. Habilitację obronił na Papieskiej Akademii Teologicznej w Krakowie w 1999, a temat jego rozprawy brzmiał: "Doświadczenie Boga w tajemnicy Jego Miłosierdzia u bł. siostry Faustyny Kowalskiej."

W latach 1991- 1995 był ojcem duchownym Wyższego Seminarium Duchownego Archidiecezji Krakowskiej. Pracował przy procesie beatyfikacyjnym św. Faustyny. W swoich publikacjach opisuje także życie innych świętych tj. św. Józefa Bilczewskiego, św. Józefa Sebastiana Pelczara, Jerzego Ciesielskiego. Zajmuje się także tematyką celibatu, dziewictwa, czystości i spraw istotnych w duchowości Kościoła. W czasie krakowskiego etapu procesu beatyfikacyjnego Sługi Bożego Jana Pawła II był także członkiem komisji historycznej, badającej jego dokumenty. Bliski współpracownik kard. Stanisława Dziwisza. Rektor Akademii Bożego Miłosierdzia. Od 2016 r. proboszcz parafii Wszystkich Świętych w Krakowie.

Ks. prof. Jan Machniak jest autorem książki "Apostołowie Bożego Miłosierdzia", która przedstawia życie św. Faustyny Kowalskiej oraz św. Jana Pawła II, a także tłumaczy genezę oraz istotę teologii Bożego Miłosierdzia, a także tekstu do albumów "Totus Tuus" i "100 lat Fatimy. Kanonizacja Hiacynty i Franciszka".